Hideo Kojima, criador da série Metal Gear, odeia por completo a versão do NES de MGS, e chamou-o de uma mancha na sua carreira. Hideo Kojima foi responsável por Metal Gear para os computadores em 1987, mas a versão NES, não esteve a seu cargo.
"Não tive qualquer participação na produção da versão para o NES. Essa versão foi um título lamentável produzido por uma pequena e barata equipe em Tóquio. Isto foi numa economia em que qualquer coisa que fosse lançada, vendia," disse Kojima à Nintendo Power.
Kojima criticou especificamente o design do jogo, dizendo que é muito ruim. "Existe uma parte que inclui uma infiltração numa base que nem sequer existe no original. Contudo, nem eu, o produtor do original, consegui infiltrar-me na base, nem sequer uma vez." O título vendeu milhões no Ocidente, mas para Kojima, apenas sujou a sua reputação.